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Guide des données de laboratoire

Intégration des données : données brutes, interfaces, formats – ce que le laboratoire et le fabricant doivent clarifier en amont

Vérifié par Dr Daniel Wallerstorfer, biologiste moléculaire et fondateur de Novogenia · Mis à jour le 13 octobre 2026 · Temps de lecture : 12 min

En bref

Pour que des données de laboratoire et génétiques deviennent un produit de suivi, elles doivent parvenir proprement au fabricant. Avant de commencer, clarifiez cinq points : quelles données sont nécessaires (gènes, valeurs sanguines, questionnaire, données corporelles), quelle est leur qualité, comment vos champs de données se correspondent (mapping), comment les données circulent en toute sécurité et ce qui vous revient. Chez Novogenia, environ 50 gènes entrent dans la formule, et les valeurs sanguines priment pour le nutriment concerné. Nous convenons avec vous de la voie de transfert et du format de données au début du projet.

Le témoin : pourquoi la transmission décide de tout

Une valeur de laboratoire parle en unités et en intervalles de référence. Un génotype parle en lettres. Une formule parle en microgrammes. Pour que vos données deviennent un produit de suivi, ces trois langages doivent se rejoindre – pour chaque client.

Imaginez la transmission des données comme une course de relais. Votre laboratoire ou votre plateforme court le premier relais : échantillon, analyse, résultat. Le fabricant court le second : interprétation, formule, production, expédition. Les courses se décident souvent non pas dans la ligne droite, mais dans la zone de transmission. Si le témoin tombe là, même le coureur le plus rapide ne peut plus rien sauver.

Cet article montre ce qu’il faut clarifier avant la première transmission : quelles données sont nécessaires, quelle qualité elles doivent avoir, comment vos champs de données se correspondent, comment les données circulent en toute sécurité et ce qui vous revient. Vous convenez avec votre partenaire des détails techniques, comme le format de fichier ou la voie de transfert, au cours du projet – mais les questions qui les sous-tendent sont toujours les mêmes.

Quelles données peuvent entrer dans une formule

Une formule personnalisée peut reposer sur plusieurs sources de données, seules ou combinées. Chez Novogenia, il y en a quatre :

Source de données	Ce qu’elle décrit	Ce qu’il faut clarifier
Génétique : génotype brut, panel SNP, résultats de tests ADN	la prédisposition ; chez Novogenia, environ 50 gènes, chacun avec trois génotypes possibles	Votre panel couvre-t-il les gènes nécessaires ? Comment le génotypage a-t-il été réalisé ?
Valeurs sanguines : par exemple vitamines, minéraux et autres marqueurs biologiques	le statut actuel en nutriments ; elles priment pour le nutriment concerné	Unité, intervalle de référence, date du prélèvement sanguin
Questionnaire	l’alimentation et le mode de vie, comme les fruits et légumes, les produits laitiers, une alimentation végane ou végétarienne, le tabac, l’alcool, l’exposition au soleil et l’entraînement	Qui le recueille, et comment est-il mis à jour ?
Données corporelles	sexe, âge, poids corporel	L’âge est recalculé à chaque production – ce qui nécessite la date de naissance.

Un bilan complet n’est pas nécessaire : une formule peut être établie à partir de nombreuses valeurs sanguines ou de quelques résultats de laboratoire ciblés. La façon dont les valeurs sanguines et les gènes modifient la dose est expliquée dans Des valeurs sanguines à la formule et Des données génétiques à la formule. Cet article traite de la question qui se pose en premier : comment les données parviennent-elles proprement au fabricant ?

Données génétiques brutes : couverture, qualité, attribution

De nombreuses entreprises de tests ADN et de nombreux laboratoires de génétique détiennent des génotypes mesurés depuis longtemps. Novogenia peut interpréter ces données brutes de génotypage ou SNP. Pour que cela fonctionne, quatre questions doivent trouver une réponse :

Couverture : environ 50 gènes entrent dans la formule. La couverture de ces gènes par votre panel ou votre puce est vérifiée au début du projet.
Qualité : quelle méthode a été utilisée pour le génotypage, et selon quelles règles de qualité ? Documentez la manière dont les valeurs manquantes ou incertaines sont signalées – un champ vide ne doit jamais être lu comme un résultat.
Attribution : chaque jeu de données doit appartenir sans ambiguïté à une personne. Un pseudonyme à la place du nom relie les deux sans que le nom voyage avec les données génétiques.
Périmètre : si vos données contiennent bien plus que les marqueurs nécessaires, par exemple des variants médicalement pertinents, convenez en amont de ce qui est transmis. Le règlement général sur la protection des données (RGPD) exige que les données soient limitées à ce qui est nécessaire au regard des finalités (art. 5, par. 1, point c). Les analyses médicales relèvent du médecin partout où la législation nationale l’exige.

Pas encore de données génétiques ? La chaîne commence alors une étape plus tôt. Novogenia fournit des kits de prélèvement salivaire, à votre design sur demande, et réalise l’analyse génétique dans son propre laboratoire ; elle prend 4 jours. Des voies intermédiaires sont aussi possibles : certains partenaires fournissent déjà de l’ADN extrait et n’ont besoin que du génotypage, d’autres transmettent des échantillons de salive. Pour en savoir plus, consultez la page analyses génétiques à façon.

Valeurs sanguines : unité, intervalle de référence, date

Les valeurs sanguines sont l’instantané de la chaîne. Elles montrent le statut actuel en nutriments et priment donc sur la génétique pour le nutriment concerné. C’est précisément pour cela que chaque détail de la transmission compte :

Quelles valeurs : le statut en micronutriments et en biomarqueurs, comme les vitamines et les minéraux, peut être traduit en recommandations concrètes de nutriments. Convenez ensemble de ceux de vos paramètres qui sont transmis.
Unité : une même valeur peut être exprimée dans des unités différentes selon le laboratoire. Chaque valeur voyage donc avec son unité – jamais comme un simple chiffre.
Intervalle de référence et méthode : ce qui est considéré comme « bas » ou « élevé » dépend aussi du laboratoire. Transmettez l’intervalle de référence, ou convenez de celui qui s’applique.
Date : une valeur sanguine décrit un moment précis. La date du prélèvement sanguin accompagne chaque valeur, et vous définissez l’ancienneté maximale d’une valeur.
Valeurs anormales : des valeurs sanguines anormales nécessitent un bilan médical – un complément alimentaire n’est pas un traitement. Convenez de qui informe le client dans ce cas.

Un avantage des valeurs sanguines : elles peuvent être répétées. Chez Novogenia, la formule est recalculée à chaque nouvelle production. Lorsque de nouvelles valeurs sanguines arrivent, le statut actuel est intégré à la production suivante.

Mapping : transformer vos champs en données de formule

Chaque laboratoire et chaque plateforme a ses propres noms de champs, codes et habitudes. Le mapping consiste à convenir une fois pour toutes de la correspondance entre chacun de vos champs et le champ correspondant chez le fabricant – et à la consigner par écrit. Points typiques :

Domaine	Ce que vous définissez
Identifiant de la personne	un pseudonyme qui reste identique dans les deux systèmes – y compris pour les renouvellements de commande et un nouveau test
Marqueurs génétiques	noms des marqueurs, comme les numéros rs, notation des génotypes, signalement des valeurs manquantes
Valeurs sanguines	paramètre, unité, intervalle de référence, date du prélèvement sanguin
Données corporelles et questionnaire	date de naissance, sexe, poids corporel, réponses dans le format convenu
Production et expédition	texte des deux lignes du sachet stick (25 caractères maximum chacune), adresse de livraison, produit et taille du conditionnement
Versions	quelle version du mapping s’applique et comment les modifications sont annoncées

Un pseudonyme protège, mais il ne rend pas les données anonymes. Les données pseudonymisées qui pourraient être attribuées à une personne par le recours à des informations supplémentaires restent des données à caractère personnel (considérant 26 du RGPD). Toutes les règles de protection des données continuent donc de s’y appliquer.

Testez le mapping avec des jeux de données de test avant que de vraies données clients ne circulent. Une erreur d’unité ou d’attribution apparaît immédiatement lors d’une livraison test – en production courante, elle n’apparaît que bien plus tard.

Transfert : sécurisé, traçable, sobre

La façon dont les données circulent dépend du volume et du flux de travail et est convenue au cours du projet. La loi fixe le cadre : les responsables du traitement et les sous-traitants mettent en œuvre des mesures techniques et organisationnelles appropriées, et le RGPD cite expressément la pseudonymisation et le chiffrement comme exemples (art. 32, par. 1, point a). En pratique, cela signifie :

Transférez les données de manière chiffrée, jamais en pièce jointe d’un e-mail non protégé.
Conservez les données génétiques et de santé séparément des noms et adresses, reliées uniquement par le pseudonyme.
Faites accuser réception de chaque livraison : qu’est-ce qui est arrivé, et qu’est-ce qui était incomplet ?
N’accordez l’accès qu’aux personnes qui en ont réellement besoin.
Convenez de qui informe qui en cas de violation de données à caractère personnel : un sous-traitant en informe le responsable du traitement dans les meilleurs délais, et le responsable du traitement la notifie à l’autorité de contrôle, si possible 72 heures au plus tard après en avoir pris connaissance (art. 33, par. 1 et 2).

L’opportunité d’un échange par fichier, via un portail ou par une interface se décide en fonction du volume. Pour les projets de santé à fort volume de cas, Novogenia met en place des kits de prélèvement, des circuits d’expédition et des interfaces, et standardise les flux de travail. Pour un projet pilote, l’essentiel est que la voie soit sécurisée et que chaque livraison reste traçable.

La technique est une moitié de la transmission ; le droit en est l’autre. Les données génétiques et les données concernant la santé font partie des catégories particulières de données à caractère personnel (art. 9, par. 1, RGPD). Et les données ne peuvent pas être traitées ultérieurement d’une manière incompatible avec la finalité initiale (art. 5, par. 1, point b). Si les données ont été collectées pour une analyse de laboratoire, vérifiez si le consentement de vos clients couvre aussi le produit de suivi et la transmission au fabricant.

Qui assume quel rôle au sein du binôme laboratoire-fabricant, qui informe les clients et ce qui diffère en Suisse est expliqué dans Protection des données et rôles entre laboratoire et fabricant.

Ce qui vous revient : produit, retours, rapports

Au bout de la chaîne se trouve le produit : une formule par personne, conditionnée en portions journalières et expédiée directement à vos clients sous votre marque. Les données qui vous reviennent en plus sont convenues au cours du projet. Ces points ont leur place sur la liste :

Confirmations : réception des données, production, expédition.
Demandes de précisions : valeurs manquantes ou non plausibles qui doivent être clarifiées avant la production.
Rapports : si l’analyse génétique est réalisée par Novogenia, le rapport est remis sous forme numérique via un portail sécurisé, imprimé sur demande et disponible en 18 langues maximum. Vous décidez si vous voyez les rapports de vos clients.
Données de formule : le retour éventuel de la formule calculée, et sous quelle forme, fait partie de l’accord de projet.

Planifiez aussi le sens inverse dès le départ. De nouvelles valeurs sanguines, un questionnaire mis à jour ou une nouvelle adresse de livraison doivent parvenir au fabricant avant le début de la production suivante. Un abonnement n’est pas un échange de données ponctuel, mais un cycle – pour en savoir plus : Des revenus récurrents grâce aux produits de suivi.

Checklist : intégration des données avant le projet pilote

Les sources de données sont définies : génétique, valeurs sanguines, questionnaire, données corporelles – ou une combinaison.
La couverture de votre panel a été vérifiée ; la voie à suivre pour les gènes manquants est claire, par exemple un nouvel échantillon de salive.
Les règles de qualité et le signalement des valeurs manquantes ou incertaines sont documentés.
Chaque valeur sanguine voyage avec son unité, son intervalle de référence et la date du prélèvement sanguin.
Le mapping est consigné par écrit et a été testé avec des jeux de données de test.
Un pseudonyme relie les jeux de données ; les données de santé et les données d’adresse sont conservées séparément.
La voie de transfert est sécurisée, les livraisons font l’objet d’un accusé de réception, et la procédure en cas de violation de données est définie.
Consentement, finalité et rôles sont réglés avant que de vraies données ne circulent.
Ce qui vous revient et la manière dont les nouvelles valeurs sont fournies avant chaque production sont convenus.

Comment nous procédons chez Novogenia

Comment nous travaillons avec les données de nos partenaires chez Novogenia :

Données existantes : nous interprétons les données brutes de génotypage et SNP, les résultats de tests ADN et les valeurs sanguines dont vous disposez déjà.
Nouvelle analyse : en l’absence de données génétiques, nous fournissons des kits de prélèvement salivaire, à votre design sur demande, et les analysons dans notre propre laboratoire à Eugendorf, près de Salzbourg, en Autriche. L’analyse prend 4 jours.
Données de base de la formule : environ 50 gènes, le sexe, l’âge, le poids corporel, un questionnaire sur l’alimentation et le mode de vie et, lorsqu’elles sont disponibles, les valeurs sanguines.
L’interprétation comme service : l’interprétation est un service, et non un logiciel que nous vous remettons pour que vous l’utilisiez seul.
Toujours à jour : la formule est recalculée à chaque production – avec l’âge actuel et de nouveaux résultats du questionnaire, sanguins ou génétiques.
Convenu pour chaque projet : nous convenons avec vous de la voie de transfert, du format de données et des retours au début du projet.

Questions fréquentes

Avec quels formats de données Novogenia travaille-t-elle ?

Nous les définissons pour chaque projet. Les données exploitables sont les données brutes de génotypage ou SNP, les résultats de tests ADN et les valeurs sanguines. Au début du projet, nous vérifions si votre panel couvre les gènes nécessaires et convenons avec vous de la forme et de la voie du transfert de données.

Que se passe-t-il si mon panel ne couvre pas tous les gènes ?

Environ 50 gènes entrent dans la formule. La couverture de ces gènes par votre panel est vérifiée au cours du projet. Si des gènes importants manquent, un nouvel échantillon de salive avec une analyse génétique dans notre propre laboratoire est une voie possible ; l’analyse prend 4 jours.

Ai-je besoin d’une interface technique pour démarrer ?

La voie de transfert adaptée dépend du volume de données et du flux de travail et est convenue au cours du projet. L’essentiel est qu’elle soit sécurisée – le RGPD cite la pseudonymisation et le chiffrement comme mesures appropriées (art. 32) – et que chaque livraison puisse être attribuée sans ambiguïté à une personne.

Quelle ancienneté les valeurs sanguines peuvent-elles avoir ?

Les valeurs sanguines décrivent le statut en nutriments à un moment donné. C’est pourquoi la date du prélèvement sanguin doit accompagner chaque valeur, et vous définissez au cours du projet l’ancienneté maximale d’une valeur. Les nouvelles valeurs reçues sont intégrées à la production suivante, car la formule est recalculée à chaque fois.

Novogenia me fournira-t-elle un logiciel pour réaliser l’interprétation ?

Non. Chez Novogenia, l’interprétation des données génétiques et sanguines est un service, et non un produit logiciel autonome. Vous fournissez les données ou nous confiez l’analyse ; nous calculons la formule et fabriquons le produit de suivi.

Des produits de suivi pour vos données ?

Dites-nous quelles données vous détenez et qui sont vos clients – nous vous montrerons quel produit de suivi vous convient.

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Remarque : Ce guide fournit des informations générales destinées aux entreprises et aux professionnels et ne remplace pas un avis médical ou juridique. Les caractéristiques génétiques déterminées dans une analyse génétique sont bien documentées (chaque gène inclus est étayé par au moins trois études indépendantes) ; les recommandations qui en découlent sont des conclusions logiques, non prouvées scientifiquement. La réglementation peut évoluer ; sous réserve d’erreurs et de modifications.