数据集成:原始数据、接口与格式——实验室与生产商需要提前明确的事项
要让实验室数据和基因数据成为后续产品,它们必须顺利送达生产商。开始之前,请明确五件事:需要哪些数据(基因、血液检测值、问卷、身体数据)、数据质量如何、您的数据字段如何对应(映射)、数据如何安全传输,以及会回传什么。在 Novogenia,约 50 个基因纳入配方,对于相关营养素,血液检测值优先。传输途径和数据格式,我们会在项目开始时与您商定。
接力棒:为什么交接决定一切
实验室检测值使用的是单位和参考范围的语言。基因型使用的是字母的语言。配方使用的是微克的语言。要让您的数据成为后续产品,这三种语言必须汇合在一起——而且是针对每一位客户。
不妨把数据交接想象成一场接力赛。您的实验室或平台跑第一棒:样本、分析、结果。生产商跑第二棒:解读、配方、生产、发货。比赛的胜负往往不是在直道上决出的,而是在交接区。如果在那里掉了棒,即使是最快的选手也无力回天。
本文说明在第一次交接之前需要明确什么:需要哪些数据、数据需要达到什么质量、您的数据字段如何对应、数据如何安全传输,以及会回传什么。文件格式或传输途径等技术细节,由您和您的合作伙伴在项目过程中商定——但其背后的问题始终相同。
哪些数据可以纳入配方
个性化配方可以基于多种数据来源,可单独使用,也可组合使用。在 Novogenia,共有四种:
| 数据来源 | 描述的内容 | 需要明确的事项 |
|---|---|---|
| 基因:基因型原始数据、SNP 检测组合、DNA 检测结果 | 倾向;在 Novogenia,约 50 个基因,每个基因有三种可能的基因型 | 您的检测组合是否覆盖所需的基因?基因分型是如何进行的? |
| 血液检测值:例如维生素、矿物质及其他实验室指标 | 当前的营养素状态;对于相关营养素,血液检测值优先 | 单位、参考范围、采血日期 |
| 问卷 | 饮食与生活方式,例如水果和蔬菜、乳制品、纯素或素食饮食、吸烟、饮酒、日晒和训练 | 由谁收集?如何更新? |
| 身体数据 | 性别、年龄、体重 | 每次生产都会重新计算年龄——这需要出生日期。 |
并不需要完整的检测组合:配方既可以基于许多血液检测值,也可以基于少数有针对性的实验室结果。血液检测值和基因如何改变剂量,详见从血液检测值到配方和从基因数据到配方。本文讨论的是首先要解决的问题:数据如何顺利送达生产商?
基因原始数据:覆盖范围、质量与对应关系
许多 DNA 检测公司和基因实验室都掌握着很早以前测得的基因型。Novogenia 可以解读此类基因型或 SNP 原始数据。为此,应当回答以下四个问题:
- 覆盖范围:约 50 个基因纳入配方。您的检测组合或芯片是否覆盖这些基因,将在项目开始时核查。
- 质量:基因分型采用了哪种方法,遵循哪些质量规则?请记录缺失或不确定的数值如何标记——空白字段绝不能被当作结果读取。
- 对应关系:每一条数据记录都必须明确地属于一个人。用假名代替姓名,可以将两者关联起来,而无需让姓名随基因数据一起传输。
- 范围:如果您的数据包含远多于所需标记的内容,例如具有医学意义的变异,请事先商定到底传输哪些数据。《通用数据保护条例》(GDPR)要求将数据限制在实现目的所必需的范围内(第5条第1款(c)项)。凡国家法律有此要求,医学分析应交由医生负责。
还没有基因数据?那么这条链条就要提前一步开始。Novogenia 提供唾液采样套装(可应要求采用您的设计),并在自有实验室中进行基因分析;分析需时 4 天。中间路线同样可行:有些合作伙伴已经提供提取好的 DNA,只需要基因分型;另一些则移交唾液样本。详见基因分析代工实验室页面。
血液检测值:单位、参考范围、日期
血液检测值是这条链条中的快照。它们显示当前的营养素状态,因此对于相关营养素,它们优先于基因数据。正因如此,交接的每一个细节都很重要:
- 哪些数值:微量营养素和生物标志物状态,例如维生素和矿物质,可以转化为具体的营养素建议。请共同商定传输您的哪些参数。
- 单位:视实验室不同,同一数值可能以不同单位报告。因此,每个数值都要连同其单位一起传输——绝不能只是一个孤零零的数字。
- 参考范围与方法:什么算“偏低”或“偏高”,也取决于实验室。请一并发送参考范围,或商定适用哪一个参考范围。
- 日期:血液检测值描述的是一个时间点。每个数值都应附上采血日期,并由您确定一个数值最长可以是多久以前测得的。
- 异常数值:异常的血液检测值需要进行医学检查——营养补充剂不是治疗。请商定在这种情况下由谁通知客户。
血液检测值的一个优点是:可以重复测量。在 Novogenia,每次新的生产都会重新计算配方。新的血液检测值到达后,当前状态就会纳入下一次生产。
映射:将您的字段转化为配方数据
每个实验室、每个平台都有自己的字段名称、代码和习惯做法。映射是指一次性商定您的哪个字段对应生产商的哪个字段——并以书面形式确定下来。典型要点包括:
| 领域 | 您需要确定的内容 |
|---|---|
| 人员 ID | 一个在双方系统中保持不变的假名——复购和新的检测时也是如此 |
| 基因标记 | 标记名称(例如 rs 编号)、基因型的书写方式、缺失值的标记方式 |
| 血液检测值 | 参数、单位、参考范围、采血日期 |
| 身体数据与问卷 | 出生日期、性别、体重、按约定格式提供的回答 |
| 生产与发货 | 条袋上两行文字的内容(每行最多 25 个字符)、送货地址、产品和包装规格 |
| 版本 | 适用哪个版本的映射,以及如何通知变更 |
假名能起到保护作用,但并不能使数据匿名。借助额外信息即可归属到某个人的假名化数据,仍然属于个人数据(GDPR 序言第26段)。因此,所有数据保护规则仍然适用于这些数据。
在真实客户数据流转之前,请用测试记录测试映射。单位或对应关系上的错误,在测试交付中会立即显现——而在正在运行的生产中,则要晚得多才会暴露出来。
传输:安全、可追溯、精简
数据如何传输取决于数据量和工作流程,并在项目过程中商定。法律划定了框架:控制者和处理者须实施适当的技术和组织措施,GDPR 明确将假名化和加密列为示例(第32条第1款(a)项)。在实践中,这意味着:
- 加密传输数据,绝不以未受保护的电子邮件附件形式发送。
- 将基因数据和健康数据与姓名和地址分开存放,仅通过假名相关联。
- 每次交付都要求确认:哪些数据已送达,哪些不完整?
- 只向真正需要的人员开放访问权限。
- 商定发生个人数据泄露时由谁通知谁:处理者应毫不延迟地通知控制者,控制者应在可行的情况下于 72 小时内通知监管机构(第33条第1款和第2款)。
通过文件交换、门户还是接口进行交换更合理,由您根据数据量决定。对于病例量大的健康项目,Novogenia 会搭建采样套装、运输路线和接口,并将工作流程标准化。对于试点而言,最重要的是途径安全、每一次交付都可追溯。
同意与目的:在第一条记录流转之前
技术是交接的一半;法律是另一半。基因数据和健康数据属于特殊类别的个人数据(GDPR 第9条第1款)。而且,数据不得以与原始目的不相容的方式进一步处理(第5条第1款(b)项)。如果数据是为实验室分析而收集的,请核查您客户的同意是否也涵盖后续产品以及向生产商的传输。
在实验室与生产商组成的团队中谁承担哪种角色、由谁告知客户,以及瑞士有何不同,详见实验室与生产商之间的数据保护与角色分工。
回传内容:产品、反馈、报告
链条的终点是产品:每人一份配方,分装为每日剂量,并以您的品牌直接发货给您的客户。此外还有哪些数据回传给您,在项目过程中商定。以下几点应列入清单:
- 确认:数据接收、生产、发货。
- 询问:需要在生产前澄清的缺失或不合理数值。
- 报告:如果基因分析通过 Novogenia 进行,报告将通过安全门户以数字形式提供,可应要求提供纸质版,最多提供 18 种语言版本。您可以决定是否查看客户的报告。
- 配方数据:计算出的配方是否以及以何种形式回传给您,是项目约定的一部分。
也请从一开始就规划反向数据流。新的血液检测值、更新后的问卷或新的送货地址,都必须在下一次生产开始之前送达生产商。订阅不是一次性的数据交换,而是一个循环——详见用后续产品创造经常性收入。
核对清单:试点之前的数据集成
- 数据来源已确定:基因、血液检测值、问卷、身体数据——或其组合。
- 您的检测组合的覆盖范围已核查;缺失基因的处理途径已明确,例如采集新的唾液样本。
- 质量规则以及缺失或不确定数值的标记方式已记录在案。
- 每个血液检测值都连同其单位、参考范围和采血日期一起传输。
- 映射已形成书面文件,并已用测试记录进行测试。
- 由假名关联各条记录;健康数据与地址数据分开存放。
- 传输途径安全,交付均有确认,个人数据泄露处理流程已确定。
- 同意、目的和角色在真实数据流转之前就已确定。
- 回传哪些内容,以及每次生产前如何提供新数值,均已商定。
常见问题
Novogenia 使用哪些数据格式?
如果我的检测组合没有覆盖所有基因,怎么办?
开始合作需要技术接口吗?
血液检测值需要多新?
Novogenia 会给我一款用于解读的软件吗?
相关内容: 实验室与生产商之间的数据保护与角色分工 · 从 SNP 数据到配方 · 从化验结果到配方
注意:本指南是面向企业和专业人士的一般性信息,不能替代医疗或法律建议。基因分析所测定的基因特征有充分的文献记载(纳入的每个基因都有至少三项独立研究支持);由此得出的建议是合乎逻辑的结论,未经科学证实。法规可能发生变化;错漏及变更除外。
