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Nutrigénétique et nutrigénomique : ce que montre la recherche

Vérifié par Dr Daniel Wallerstorfer, biologiste moléculaire et fondateur de Novogenia · Mis à jour le 12 octobre 2026 · Temps de lecture : 13 min

7 500 ans de lait : le cas d’école de la nutrigénétique

Il y a environ 7 500 ans, des agriculteurs établis quelque part entre les Balkans centraux et l’Europe centrale élevaient des animaux laitiers – et buvaient du lait. Le hic : la plupart des adultes de l’époque digéraient à peine le sucre du lait. Ceux qui portaient un variant génétique particulier, eux, le pouvaient. Ils avaient un avantage, et le variant s’est répandu (Itan et al., PLoS Computational Biology 2009).

Aujourd’hui, on connaît l’endroit exact : dans des familles finlandaises, le variant C/T-13910, situé en amont du gène LCT, était entièrement associé à une non-persistance de la lactase vérifiée biochimiquement (Enattah et al., Nature Genetics 2002). Ce « variant du lait » est fréquent chez les personnes d’ascendance européenne et rare dans de nombreuses autres régions du monde.

Voilà la nutrigénétique en une phrase : le même aliment rencontre des gènes différents – et agit donc différemment. Et c’est précisément ce qui la rend si précieuse pour votre accompagnement.

Livre de recettes et interrupteur : nutrigénétique ou nutrigénomique ?

Les deux termes se ressemblent presque, mais ils regardent dans des directions opposées :

• La nutrigénétique – le livre de recettes : votre ADN est comme un très long livre de recettes, et chez chaque personne, quelques recettes sont rédigées de façon légèrement différente. La nutrigénétique pose la question : comment ces différences modifient-elles la façon dont votre client absorbe et dégrade les nutriments et réagit à son alimentation ?
• La nutrigénomique – l’interrupteur : ici, l’alimentation agit comme un interrupteur qui active et désactive les gènes. Un exemple : PPARγ est le centre de commande de la formation des cellules graisseuses, et l’activité de sa forme PPARγ2 dans le tissu adipeux humain dépend de l’obésité et de facteurs nutritionnels (Deeb et al., Nature Genetics 1998).

Pour votre accompagnement, c’est la nutrigénétique qui compte – c’est d’elle que proviennent les analyses génétiques dont vous discutez avec vos clients. La nutrigénomique en fournit le socle : elle montre comment l’alimentation agit jusqu’à l’intérieur de la cellule.

Un mot sur le vocabulaire : dans les passages vulgarisés de ce guide, nous parlons souvent de gènes « fonctionnels » ou « efficaces » et de gènes « altérés ». Il s’agit d’une simplification délibérée, que nous utilisons aussi dans nos rapports. Sur le plan technique, il s’agit de variants génétiques (polymorphismes) – des différences courantes dans l’ADN qui rendent un gène un peu plus ou un peu moins efficace, et non de gènes « défectueux ».

Cet article répond à la question qui compte dans votre pratique professionnelle : que montre la recherche – et comment l’utiliser ?

Trois niveaux de personnalisation – chacun repose sur le précédent

L’International Society of Nutrigenetics/Nutrigenomics (ISNN) décrit la nutrition personnalisée comme un escalier à trois marches (Ferguson et al., Journal of Nutrigenetics and Nutrigenomics 2016) :

1. Des recommandations générales pour des groupes définis par l’âge, le sexe et les déterminants sociaux.
2. Une nutrition individualisée qui intègre des informations sur l’état actuel : mesures corporelles, valeurs sanguines et métaboliques, activité physique.
3. Une nutrition guidée par le génotype qui prend en compte, en plus, des variants génétiques rares ou fréquents.

Chaque marche rend l’accompagnement plus personnel. Les gènes montrent vers quoi une personne tend. Le phénotype – valeurs mesurées et données corporelles – montre où elle en est aujourd’hui. Ensemble, ils vous donnent une image complète.

L’échelle des preuves : comment la recherche met au jour les effets des gènes

Imaginez la recherche comme une échelle. Chaque barreau ajoute une pièce au puzzle – du laboratoire au quotidien. Les effets génétiques bien documentés reposent sur plusieurs barreaux à la fois.

Pour votre accompagnement, cela signifie : pour chaque affirmation, demandez-vous sur quels barreaux elle repose. Plus il y a de barreaux, plus le terrain est solide.

Là où la recherche repose sur des bases solides

Pour de nombreux couples gène–nutriment, le mécanisme, des observations répétées et, en partie, des études d’intervention concordent bien :

• Sucre du lait (LCT) : l’exemple du début – l’un des liens les mieux compris de la génétique humaine.
• Folates (MTHFR) : MTHFR est l’outil qui convertit les folates en leur principale forme circulante. Le variant 677C>T rend cet outil moins actif (Frosst 1995). Une méta-analyse menée chez des femmes en bonne santé a mis en évidence un net gradient des folates sanguins : valeurs les plus élevées avec deux copies fonctionnelles du gène (CC), les plus basses avec deux copies altérées (TT) (Tsang et al., American Journal of Clinical Nutrition 2015).
• Caféine (CYP1A2) : CYP1A2 est l’outil de votre organisme contre la caféine. Un variant fréquent contribue à déterminer dans quelle mesure cet outil peut être stimulé – chez les fumeurs, les personnes de génotype AA dégradaient la caféine nettement plus vite (Sachse et al., British Journal of Clinical Pharmacology 1999). Le sport montre à quel point c’est concret : la même dose de caféine a rendu les porteurs AA plus rapides lors d’un contre-la-montre (Guest et al. 2018).
• Oméga-3 (FADS1/FADS2) : dans une méta-analyse pangénomique portant sur 8 866 personnes, des variants de ces gènes de conversion étaient fortement associés aux taux sanguins des acides gras oméga-3 ALA, EPA et DPA (Lemaitre et al., PLoS Genetics 2011).

Tous les gènes en détail – ce qu’ils font, ce que montre la recherche et ce que cela signifie pour le conseil – se trouvent dans Les gènes clés pour le conseil nutritionnel.

Là où cela devient passionnant : gènes, alimentation et comportement

La recherche va aujourd’hui bien au-delà des gènes isolés. Elle étudie comment gènes et alimentation agissent ensemble – et comment les personnes mettent à profit leurs connaissances génétiques :

• Interaction gène–alimentation confirmée : pour APOA2, un IMC plus élevé n’était associé au génotype CC que lorsque les personnes consommaient beaucoup de graisses saturées – dans trois populations indépendantes. Les auteurs la décrivent comme la première interaction gène–alimentation sur l’IMC à avoir été répliquée de façon aussi solide et cohérente (Corella et al., Archives of Internal Medicine 2009).
• Le personnalisé l’emporte sur le général : dans l’étude européenne Food4Me (1 269 participants l’ont menée à terme), des conseils personnalisés – fondés sur l’alimentation de la personne, en partie combinée à des valeurs mesurées et aux gènes – ont davantage amélioré l’alimentation que des recommandations générales : moins de viande rouge, de sel et de graisses saturées, davantage de folates (Celis-Morales et al., International Journal of Epidemiology 2017).
• Les connaissances génétiques peuvent changer les comportements : les porteurs d’un variant ACE à qui l’on avait, pour cette raison, conseillé de manger moins salé ont davantage réduit leur apport en sodium que le groupe témoin au bout de 12 mois (Nielsen and El-Sohemy, PLoS One 2014). Dans l’essai NOW, seul le groupe disposant d’informations génétiques a réduit significativement son apport en graisses au bout de 12 mois (Horne et al., BMJ Nutrition, Prevention & Health 2020).
• Le poids, un travail d’équipe : pour le poids corporel, la recherche a déjà identifié 97 loci (Locke et al., Nature 2015). Aucun gène ne décide seul – d’où l’intérêt de bonnes analyses qui regroupent plusieurs gènes. Dans une étude interne de Novogenia menée auprès de 302 personnes, les participants suivant un régime fondé sur les gènes ont perdu environ 2,4 fois plus de poids qu’avec un régime standard.

Comment gènes et mode de vie agissent ensemble : c’est l’objet de Les gènes ne sont pas une fatalité : comment gènes et mode de vie agissent ensemble.

Ce que recommandent les sociétés savantes

• ISNN (2016) : les différences de profil génétique influencent les besoins en nutriments, le métabolisme et la réponse à l’alimentation. La nutrition personnalisée doit reposer sur un socle solide de connaissances issues de la nutrigénétique et de la nutrigénomique – et la société considère que son rôle est de promouvoir la science et de garantir des affirmations fondées (Ferguson et al. 2016).
• Cadre d’évaluation (2017) : un groupe d’experts a élaboré un cadre pour évaluer la validité scientifique d’une affirmation gène–alimentation et sa possibilité de mise en pratique – comme base de conseils transparents et scientifiquement fondés, reposant sur des tests nutrigénétiques (Grimaldi et al., Genes & Nutrition 2017).
• Academy of Nutrition and Dietetics (États-Unis, 2014) : la génomique nutritionnelle montre comment l’alimentation et le génotype interagissent pour façonner le phénotype. Les professionnels de la nutrition ont besoin pour cela de compétences de base en génétique ; les antécédents familiaux, les valeurs de laboratoire et les facteurs de risque restent des outils importants de personnalisation (Camp and Trujillo, Journal of the Academy of Nutrition and Dietetics 2014).

Le fil conducteur : la nutrigénétique doit être entre des mains compétentes et montre sa valeur en association avec l’anamnèse alimentaire et les valeurs mesurées – et c’est précisément là qu’intervient votre accompagnement.

Gène, recommandation, mise en pratique : trois niveaux

Un bon conseil nutrigénétique distingue trois niveaux – puis les relie en un plan clair :

Chez Novogenia, nous le formulons ainsi : les caractéristiques génétiques déterminées dans une analyse génétique sont bien documentées – chaque gène inclus est étayé par au moins trois études indépendantes. Les recommandations qui en découlent sont des conclusions logiques, non prouvées scientifiquement. Cette clarté vous rend crédible lors des entretiens. Pour en savoir plus : Notre approche scientifique expliquée.

Checklist : comment reconnaître des affirmations bien étayées

• Taille : l’effet a-t-il été étudié chez de nombreuses personnes ?
• Réplication : des groupes de recherche indépendants l’ont-ils retrouvé à plusieurs reprises ?
• Ascendance : la population étudiée correspond-elle à votre client ? La fréquence des variants génétiques varie à travers le monde – souvenez-vous du « variant du lait ».
• Ampleur de l’effet : quelle est la différence en kilogrammes, en pourcentage ou en minutes ?
• Mécanisme : sait-on ce que fait le gène dans l’organisme ?
• Séparation claire : le rapport distingue-t-il la caractéristique génétique de la recommandation ?

Pour votre accompagnement : les gènes comme élément de base

• Les gènes complètent le tableau : associés à l’anamnèse alimentaire, aux données corporelles et aux valeurs sanguines, ils rendent votre accompagnement plus personnel.
• Une tendance, pas un verdict : présentez les résultats comme une prédisposition qui interagit avec l’alimentation, l’activité physique et l’environnement. Les gènes ne sont pas une fatalité – votre client peut agir.
• Le dire clairement : la caractéristique est documentée ; la recommandation qui s’appuie sur elle est une conclusion logique.
• Confier la partie médicale : les analyses liées à des maladies – comme HLA-DQ2/DQ8, HFE, APOE ou les facteurs de thrombose – ainsi que la pharmacogénétique sont des analyses médicales. Lorsque la législation nationale l’exige, elles relèvent du corps médical.

Comment expliquer clairement les résultats lors d’un entretien : c’est l’objet de Expliquer clairement un rapport génétique.

Questions fréquentes

À lire aussi: Les gènes clés pour le conseil nutritionnel · Les gènes ne sont pas une fatalité : comment gènes et mode de vie agissent ensemble · Comment Novogenia évalue les affirmations scientifiques

Remarque : Ce guide fournit des informations générales destinées aux professionnels et ne remplace pas un avis médical ou juridique. Les caractéristiques génétiques déterminées dans une analyse génétique sont bien documentées (chaque gène inclus est étayé par au moins trois études indépendantes) ; les recommandations sur l’alimentation, les micronutriments et le mode de vie qui en découlent sont des conclusions logiques, non prouvées scientifiquement. La réglementation peut évoluer ; sous réserve d’erreurs et de modifications.